作曲与指挥系为浙江音乐学院的重点建设系部之一，是在原杭州师范大学音乐学院作曲系基础上通过划转、引进、招聘统筹建制而成。现含有作曲、指挥两个主要专业，下设作曲、作曲技术理论、基础乐科、指挥四个教研室，公共理论教学教研室也正在筹建当中。共有作曲、音乐作品分析、和声、曲式、复调、配器、乐队指挥、合唱指挥等数个学科方向。承担着学院主要的音乐专业理论课程以及管弦乐队合奏重奏、民乐团合奏、合唱等实践教学工作。

我系师资力量雄厚，目前在编在岗教师共28人，均毕业于中央音乐学院、上海音乐学院、四川音乐学院、沈阳音乐学院、英国皇家音乐学院、美国密歇根州立大学等国内外一流音乐院校。期中具有正高职称或博士学位教师13人，占系总教师数的46%，副高或硕士学位10人，占总教师数36%。另包括外籍教授2人，专职行政人员2人。

作曲与指挥系以培养作曲家和作曲技术理论人才、专业指挥人才为宗旨，坚持教学、创作、科研、艺术实践为一体的教学管理体系。教学、科研成果显著。我系教师作品曾多次获得“美国作曲家协会作曲比赛”“中国音乐金钟奖”“浙江省音乐舞蹈节”等国际、国内、省部级专业奖项；我系指挥教师亦多次获得国际合唱比赛、金钟奖等国际国内专业赛事金奖。并多次承担国家、省部级各类创作、实践演出任务，获得界内外的一致好评。所指导的学生亦多次在中国教育学会音乐教育举办的室内乐作品评比、专业学术论文评比中获奖。